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Título: Caracterização de Pitcairnia flammea (Bromeliaceae), ocorrente em fragmentos de Mata Atlântica, por meio de ferramentas biotecnológicas
Título(s) alternativo(s): Genetic diversity in natural populations of Pitcairnia flammea and transferability of SSR and ISSR primers
Autor(es): Nogueira, Ester Ujiie
Orientador: Gontijo, Andréia Barcelos Passos Lima
Palavras-chave: Bromélia Biotecnologia
Bromélia Genética vegetal
Bromélia Recursos do germoplasma
Bromélia Melhoramento genético
Bromélia Mata Atlântica Conservação
Data do documento: 31-Mar-2010
Editor: Universidade Federal do Espírito Santo
Citação: NOGUEIRA, Ester Ujiie. Genetic diversity in natural populations of Pitcairnia flammea and transferability of SSR and ISSR primers. 2010. 78 f. Dissertação (Mestrado em Fitotecnica; Recursos Florestais) - Universidade Federal do Espírito Santo, Vitória, 2010.
Resumo: Os marcadores moleculares RAPD são úteis para a análise da diversidade genética possibilitando uma amostragem mais ampla de genomas desconhecidos. Os marcadores SSR e ISSR também são utilizados para esse fim, mas ainda existem poucos desenvolvidos para Bromeliaceae, o que implica na validação da sua transferibilidade entre espécies dessa família. O objetivo deste trabalho foi estudar a variabilidade genética de P. flammea utilizando marcadores RAPD e testar a transposição de marcadores SSR e ISSR para esta espécie. Foram utilizados 8 primers RAPD no estudo de diversidade e para a validação da transferibilidade de marcadores moleculares foram usados 4 primers ISSR e 1 SSR. Os 8 primers RAPD geraram um total de 55 bandas, sendo 41 polimórficas. Do total da variância genética molecular encontrada, 69.18% se devem às diferenças entre indivíduos dentro de cada local de coleta e 30,82% é atribuída às divergências entre os três locais amostrados. A variação genética entre populações, Gst=0,2340, indicou grande proximidade genética. As populações pertencentes aos locais de coleta mais próximos geograficamente apresentaram menor distância genética entre si (0,04) refletindo em maior identidade genética (0,9714). A maior variação genética foi observada entre os indivíduos amostrados no Local de coleta III, portanto a população existente nesta localidade pode ser considerada prioritária em trabalhos de conservação. Nos ensaios de transposição, foram obtidas 17 bandas com os marcadores ISSR, sendo 6 polimórficas. Para o marcador SSR, foi produzida 1 banda monomórfica. Os marcadores RAPD foram eficientes para analisar a diversidade genética de P.flammea intra e interpopulacional e a transferibilidade dos marcadores SSR e ISSR foi validada em P. flammea
RAPD molecular markers are useful for analyzing genetic diversity, enabling a broader sampling of unknown genomes. SSR and ISSR markers are also used for this purpose, but still only a few are developed to Bromeliaceae, which implies the validation of their transferability among species of this family. This study aims at studying the genetic variability of P. flammea by means of RAPD markers and testing the transposition of SSR and ISSR markers for this species. 8 RAPD primers were used in the study of diversity, and 4 ISSR primers and 1 SSR primer were used to validate the transferability of molecular markers. The 8 RAPD primers generated a total of 55 bands, 41 of which polymorphic. From the total molecular genetic variance found, 69.18% are due to the differences between individuals within each collection site, and 30.82% are due to differences between the three sites sampled. The genetic variation among populations, Gst=0.2340, has indicated great genetic proximity. The populations belonging to the geographically closest collection sites presented a smaller genetic distance between them (0.04), reflecting a greater genetic identity (0.9714). The greatest genetic variation was observed among the individuals sampled in the Collection Site III, so the existing population in this site may be considered a priority in conservation works. In the tests of transposition, 17 bands were obtained with ISSR markers, 6 of which being polymorphic. For the SSR marker, 1 monomorphic band was produced. RAPD markers were efficient for analyzing the intra and inter populational genetic diversity of P. flammea, and the transferability of SSR and ISSR markers was validated in P. flammea
URI: http://repositorio.ufes.br/handle/10/6637
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